گروه میکروبیولوژی دانشگاه تهران با بیش از ۴۰ سال سابقه در حوزه  ‌های سیستماتیک میکروبی، علــــوم و فناوری-‌های میکروبی، میکروب شناسی پزشکی، میکروب شناسی کاربردی و زیسـت فناوری میکروبی فعالیت داشــــته و ارتباط مستمری با صنعت و مراکز تولیدی و بهداشتی و درمانی دارد.
 دانشجویان در مقاطع کارشناسی، کارشناسی ارشد و دکتری تخصصی، در زمینه  ‌های سیستماتیک میکروبی، علوم و فناوری  ‌های میکروبی، میکروب شناسی پزشکی، میکروب شناسی محیطی، زیست فناوری میکروبی، ویروس شناسی و قارچ شناسی آشنا شده و پژوهش می نمایند. فارغ التحصیلان گروه میکروبیولوژی، در سازمان ها و مراکز اجرایی - پژوهشی، در حوزه‌های مرتبط با صنایع نفت و پتروشیمی،  بهداشتی- دارویی، غذایی و بسته بندی و رفع آلودگی محیط زیست و تصفیه آب و پساب و  مشغول به کار شده  اند.
این گروه با تأسیس کلکسیون میکروبی دانشگاه تهران مجموعه متنوعی از میکروارگانیسم  ‌ها را تهیه نموده و خدمات پژوهشی - اجرایی ارائه می‌کند. علاوه براین، گروه میکروبیولوژی، تفاهم نامه  ‌های همکاری مشترک با گروه میکروب شناسی دانشگاه الزهرا، دانشگاه شهید بهشتی و مرکز ملی ذخایر ژنتیک و زیستی ایران دارد که به منظور افزایش توانمندی‌  ها و پاسخ گویی به نیازها در سطح ملی می باشد.

زمینه های پژوهشی گروه میکروبیولوژی

• ژنتیک و بیوتکنولوژی میکروبی
• بیماری های باکتریایی انسان
• زیست شناسی و بیوتکنولوژی اکستریموفی
• تاکسونومی و فیلوژنی باکتری ها و آرکی ها
• ویروس های نوترکیب
• میکروRNA
• راهکارهای جدید درمانی برای مقابله با باکتریهای مقاوم به دارو
• ترکیبات زیست فعال و زیست فناوری دارویی
•  میکروبیولوژی محیطی