رساله های دکتری

1. شناسایی برهمکنش های کشنده توامان در سرطان با استفاده از شبکه های متابولیکی
   احسان زنگنه 1403
2. بررسی پاسخ برنج (Oryza sativa) به تنش سرما ازطریق اختصاصی کردن مدل متابولیکی ژنوم مقیاس
   فاطمه سلطانی 1403
3. رتبه بندی خصیصه ها در آنالیز های متاژنومی مربوط به میکروبیوم سرطان
   زهرا توکل همدانی 1402
4. چارچوبی محاسباتی برای شناسایی استراتژی‌های حذف ژن برای بهینه‌سازی تولید متابولیت در کنسرسیوم‌های میکروبی دو سویه‌ای
   سورن سلاجقه 1401
5. بهینه سازی تولید یک پادتن تک دودمانی در سلولهای CHO به کمک روشهای زیست شناسی سامانه ها
   حمیده فولادیها 1401
6. فارماکولوژی سامانه ای ساختاری چارچوبی برای ادغام شبکه متابولیک و غربالگری مجازی مبتنی بر ساختار برای کشف دارو علیه پاتوژن ها
   المیرا نظر شده 1401
7. به دست آوردن تابع هدف شبکه متابولیک با استفاده از داده های transcriptome
   فاطمه حیدری 1401
8. بازسازی شبکه متابولیک باکتری متعلق به جنس مایکروباکتریوم به عنوان یک سویه بالقوه مفید در تولید هیدروژن توسط ریزجلبک
   حمیدرضا علی مردان 1400
9. ساخت و تعیین خصوصیات گیرنده Synotch برعلیه آنتی ژن CD19
   یاسمن اسعدی 1400
10. تشخیص نمونه های مربوط به افراد سالم از نمونه های بیماران مبتلا به سرطان روده با استفاده از آنالیز توالی های متاژنوم حاصل از مدفوع توسط روش های یادگیری ماشین
    آرمین سلیمانی نیا 1400
11. مهندسی متابولیک مسیر تولید اتانول به کمک مدل شبکه متابولیک Zymomonas mobilis و ارزیابی اثر آن بر میزان تولید محصول
    هدی نوری 1400
12. بازسازی شبکه متالولیک اسپرم انسان : کنکاشی پیرامون مکانیسم نازایی مردان به منظور درک آن
    آروند اصغری خنکداری 1400
13. ارائه یک روش محاسباتی مبتنی بر سیستم های توصیه گر برای پیش بینی عوارض جانبی داروها
    سهیلا شعبانی مشکول 1399
14. شناسایی امضاهای مولکولی اختصاصی زیرگونه های مختلف بیماری آلزایمر
    آناهیتا نظری یایچی 1399
15. ارائه رویکردی برای بررسی تغییرات عملکردی و تاکسونومیکی میکروبیوم پروکاریوتی روده انسان
    محمدحسین نوروزی بیرامی 1399
16. مطالعه تجربی و مدل سازی متابولیسم تولید هیدروژن در کنسرسیوم جلبک- باکتری
    ندا فخیمی 1398
17. بررسی سیستمی اثر بالقوه جهش های متابولیک بر ایجاد اختلالات طیف اوتیسم
    موهبت پورمجیدیان 1398
18. مدل سازی مبتنی بر قید شبکه متابولیک فتوسنتزی به منظور استنتاج پیشران‌ها وخط سیرهای تکامل فتوسنتز C4 از C3
    ارمین دادرس 1398
19. بررسی اثر ترکیبات تاثیرگذار پیش بینی شده از طریق مدلسازی مبتنی بر قید بر بیان آنزیم یوریکاز نوترکیب در باکتری /شریشیا کلای
    نجمه سادات سیدکتولی 1398
20. بررسی توانایی متابولیسمی خانواده Salinibacteraceae براساس داده‌های ژنومیک
    مریم باقری 1398
21. بررسی تعییرات پروفایل بیان ژنی سلولهای بنیادی جنینی انسان در حالت Naive و Primed به منظور بازسازی مدل شبکه متابولیک و مطالعه تفاوت وضعیت متابولیک این دو نوع سلو
    میثم یوسفی 1397
22. ایجاد روشی برای برطرف کردن شکاف ها در شبکه های متابولیک با استفاده ار آنالیز همراهی شارها و اطلاعات بیان ژن های متابولیک
    ژاله حسینی 1397
23. عنوان شبیه سازی رشد و متابولیسم تومور با استفاده از مدلهای in vitro و in silico
    مهشید حیدری 1397
24. بازسازی شبکه متابولیکی سودوموناس اشتوتسری A1501
    پریزاد بابائی 1396
25. مهندسی متابولیک اشرشیاکلی به منظور افزایش مالونیل کوآ به عنوان متابولیت محدودکننده در مسیر فنیل بروپانوئیدها
    محمدحسین متالهی اردکانی 1396
26. آنالیز توالیهای چاملئونی و بررسی نقش آنها در برخی از بیماریهای مهم سیستم عصبی با استفاده از داده پایگاه های برهمکنش پروتئینی
    گلناز بهرامعلی 1396
27. بررسی تاثیر microRNA های ویروسی دخیل در خفتگی ویروس HSV-1 بر روی ژن های مسیر ?TGF-
    زهرا شجاعی جشوقانی 1396
28. کنترل بیان ژن های موثر در بیماری آلزایمر با روش های تداخل در RNA
    سعیده حسینیان 1396
29. کاربرد شبکه های متابولیکی ژنوم مقیاس در پیش بینی تفاوت ها در توانمندیهای بیوشیمیایی بین دو گونه سودوموناس و نیز دو گونه باسیلوس
    طاهره قاسمی کهریز سنگی 1396
30. دگر تمایزی سلول های فیبروپلاست به سلول های بنیادی عصبی با استفاده از روش هدایت پروتئینی
    مهدیه هادی 1396
31. بررسی الگوهای تنظیم شبکه های زیستی توسط MicroRNA ها با رویکرد بیوانفورماتیکی
    مهدی احمدی 1396
32. بررسی شبکه متابولیکی جهت ارائه تعریفی جدید از اهمیت ژنها به کمک آنالیز همراهی شار
    سیدمحمدامین کمال الدین عزآبادی 1396
33. پروژه
    سلما سهرابی جهرمی 1396
34. شناسایی حالت های پایه ای در شبکه های متابولیکی
    شایان تابع بردبار 1396